| 反渗透膜系统在运行时受到给水中的碳酸钙、硫酸钙、微生物、无机物、金属氧化物等物质的污染。这些物质沉积在反渗透反渗透膜表面损坏膜元件的性能，引起设备脱盐率下降、压差升高等，必须对反渗透膜进行有效的化学清洗。
对反渗透膜清洗时，需先确认引起污染的原因、并针对污染状况选择化学药剂、确定清洗方案。
1、当加酸pH调节系统出故障引起水pH值变高或阻垢剂系统故障，就会沉积碳酸钙垢，为防止反渗透膜表面沉积的晶体损伤膜元件，可降低水PH值进行去除。同时可用低pH值的柠檬酸清洗液循环清洗或浸泡过夜来清除沉淀时间较长的碳酸钙垢。
2、硫酸钙垢是不易去除的坚硬的矿物质垢。在阴垢剂系统故障或加硫酸调节pH时沉积硫酸钙垢，使用硫酸钙垢清洗液可将反渗透膜表面的硫酸钙垢去除。
3、金属氧化物垢多是空气中氧化的金属离子或设备的腐蚀产物所导致，可用低pH值的柠檬酸清洗液进行循环清洗或浸泡过夜来去除沉积的氢氧化物。
4、微生物细菌粘泥等有机沉积物，可用清洗液清除并杀菌，抑制沉积物的生长，并作清洁预处理等。
5、由金属氧化物或有机物共生的硅垢，可用传统的化学清洗方法进行清洗。
6、无机污染物用柠檬酸清洗液清洗即可。
对反渗透膜清洗时，清洗液的PH不可低于2.0 ，以免损害膜元件，可用氨水来提高PH值。
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